Una vez finalizadas todas las ligas departamentales, la siguiente instancia del torneo es la etapa nacional, la cual contará con la participación de 50 equipos (25 campeones departamentales y 25 subcampeones).
Por el departamento de Huánuco el campeón es el Independiente de Huachog que venció por 4-2 en el global al Castle FC y ahora ambos jugarán por primera vez en sus respectivas historias la Etapa Nacional.
Es importante indicar que, la etapa nacional del ‘fútbol macho’, se inicia el 16 de septiembre con una primera etapa en la que los equipos son agrupados según su cercanía geográfica. Afrontarán seis fechas, en la que, conforme se dispute cada jornada, se irá formando una tabla de posiciones generales.
Los cuadros que se ubiquen entre los 32 primeros lugares, serán los que clasifiquen a la segunda fase; el resto de equipos queda eliminado del torneo.
Los campeones departamentales de la Copa Perú 2023, son:
- Tumbes: Renovación Pacífico
- Piura: Olimpia de La Unión
- Lambayeque: Juan Pablo II
- La Libertad: Defensor Porvenir
- Áncash: FC San Marcos
- Lima: Deportivo Huracán
- Callao: Calidad Porteña
- Ica: Alianza Pisco
- Arequipa: Nacional FBC
- Moquegua: Hijos del Altiplano
- Tacna: Bentín Tacna Heroica
- Cajamarca: ADA de Jaén
- Amazonas: Unión Santo Domingo
- Pasco: Ecosem Pasco
- Junín: CESA de Huancayo
- Huánuco: Independiente Huachog
- Huancavelica: Deportivo Vianney
- San Martín: AD Tahuishco
- Loreto: Atlético Hospital
- Madre de Dios: La Masía Nace
- Apurímac: Miguel Grau o FC Challhuahacho
- Cusco: AJI de Calca o Defensor Cubillas
- Ayacucho: Sport Cáceres o VRAEM FC
- Puno: Diablos Rojos o Deportivo Universitario o Ángeles de Vizcachani
- Ucayali: Inter FC o Escuela Municipal de Tournavista
